Os índios Cheréns foram os primeiros a fazerem uso das terras que é hoje o município de Santa Filomena. Quem os expulsou de lá foi o coronel José Lustosa da Cunha que por volta de 1858 chegou ali com mulher, parentes e escravos. Nascido com a denominação de Santa Filomena, foi elevado à categoria de vila com a denominação de Santa Filomena, desmembrado de Parnaguá. Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o município é constituído a partir do distrito sede. A área oficial do município de Santa Filomena atualmente é de 5.284km² e no recenseamento de 2010, consta com 6.096 habitantes, com um crescimento populacional na ordem de 3,90% em relação ao censo do ano de 2000.
